沙漠林业实验中心三实验场村行政区划上隶属于内蒙古自治区巴彦淖尔市磴口县，沙漠林业实验中心三实验场村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区巴彦淖尔市磴口县。