呼伦贝尔市阿荣旗格尼河农场行政区划上隶属于阿荣旗，阿荣旗隶属于格尼河农场，格尼河农场隶属于呼伦贝尔市，呼伦贝尔市阿荣旗格尼河农场的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于呼伦贝尔市。