尼尔基镇行政区划上隶属于内蒙古自治区呼伦贝尔市莫力达瓦达斡尔族自治旗，尼尔基镇的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区呼伦贝尔市莫力达瓦达斡尔族自治旗。