代力吉镇巴特根种畜场行政区划上隶属于科尔沁左翼中旗，科尔沁左翼中旗隶属于通辽市，通辽市隶属于内蒙古自治区，代力吉镇巴特根种畜场的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区。