巴彦花镇苗圃村行政区划上隶属于内蒙古自治区赤峰市阿鲁科尔沁旗，巴彦花镇苗圃村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区赤峰市阿鲁科尔沁旗。