新店子镇黑石兔村行政区划上隶属于内蒙古自治区呼和浩特市和林格尔县，新店子镇黑石兔村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区呼和浩特市和林格尔县。