毕克齐镇小古城村行政区划上隶属于土默特左旗，土默特左旗隶属于呼和浩特市，呼和浩特市隶属于内蒙古自治区，毕克齐镇小古城村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区。