北马神庙街行政区划上隶属于新城区，新城区隶属于呼和浩特市，呼和浩特市隶属于内蒙古自治区，北马神庙街的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区。