叶尔盖提南区农五连行政区划上隶属于塔城市，塔城市隶属于塔城地区，塔城地区隶属于新疆维吾尔自治区，叶尔盖提南区农五连的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区。