木图斯托博二连行政区划上隶属于察布查尔锡伯自治县，察布查尔锡伯自治县隶属于伊犁哈萨克自治州，伊犁哈萨克自治州隶属于新疆维吾尔自治区，木图斯托博二连的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区。