新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州霍尔果斯市良种繁育中心行政区划上隶属于霍尔果斯市，霍尔果斯市隶属于良种繁育中心，良种繁育中心隶属于伊犁哈萨克自治州，新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州霍尔果斯市良种繁育中心的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于伊犁哈萨克自治州。