巴音库鲁提乡克孜勒阿根村行政区划上隶属于乌恰县，乌恰县隶属于克孜勒苏柯尔克孜自治州，巴音库鲁提乡克孜勒阿根村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于克孜勒苏柯尔克孜自治州。