昆屯仑八十八团二连行政区划上隶属于新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州温泉县，昆屯仑八十八团二连的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州温泉县。