蒙古庙八十六团值班连行政区划上隶属于新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州博乐市，蒙古庙八十六团值班连的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州博乐市。