巴里坤花园乡南园子村行政区划上隶属于巴里坤哈萨克自治县，巴里坤哈萨克自治县隶属于哈密地区，哈密地区隶属于新疆维吾尔自治区，巴里坤花园乡南园子村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区。