博尔羌吉镇行政区划上隶属于巴里坤哈萨克自治县，巴里坤哈萨克自治县隶属于哈密地区，博尔羌吉镇的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于哈密地区。