伊吾县山南开发区三区行政区划上隶属于新疆维吾尔自治区哈密地区哈密市，伊吾县山南开发区三区的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区哈密地区哈密市。