小东沟行政区划上隶属于乌鲁木齐县，乌鲁木齐县隶属于乌鲁木齐市，乌鲁木齐市隶属于新疆维吾尔自治区，小东沟的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于新疆维吾尔自治区。