马尼干戈错阿乡行政区划上隶属于德格县，德格县隶属于甘孜藏族自治州，甘孜藏族自治州隶属于四川省，马尼干戈错阿乡的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于四川省。