曲高纳乡瓜子村行政区划上隶属于舟曲县，舟曲县隶属于甘南藏族自治州，曲高纳乡瓜子村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于甘南藏族自治州。