三墩乡祁家沟村行政区划上隶属于肃州区，肃州区隶属于酒泉市，酒泉市隶属于甘肃省，三墩乡祁家沟村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于甘肃省。