牙屯堡镇行政区划上隶属于通道侗族自治县，通道侗族自治县隶属于怀化市，怀化市隶属于湖南省，牙屯堡镇的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于湖南省。